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PROFESIONALES

Crean una aplicación que estima el potencial zoonósico de los virus

Un equipo internacional de científicos ha desarrollado la primera aplicación en código abierto que estima el potencial zoonósico y pandémico de los virus de la fauna silvestre, y el Covid-19 no es el primero

La aplicación de código abierto SpillOver evalúa el potencial de dar saltos zoonósicos de los virus recién descubiertos..
La aplicación de código abierto SpillOver evalúa el potencial de dar saltos zoonósicos de los virus recién descubiertos..

Crean una aplicación que estima el potencial zoonósico de los virus

Un equipo internacional de científicos ha desarrollado la primera aplicación en código abierto que estima el potencial zoonósico y pandémico de los virus de la fauna silvestre, y el Covid-19 no es el primero

Redacción - 06-04-2021 - 15:18 H

El Covid-19 ha demostrado al mundo la amenaza que pueden suponer los virus emergentes para la salud pública mundial. En este sentido, la Organización Mundial de la Salud ha alertado de que cada vez habrá más saltos zoonósicos de estos patógenos.

Ahora, la Universidad de California Davis (UC Davis), junto a expertos de todo el mundo, ha desarrollado una nueva aplicación web, SpillOver, que clasifica el riesgo de propagación de los virus recién descubiertos de la vida silvestre a los humanos.

SpillOver es la primera herramienta de evaluación de riesgos de código abierto que evalúa los virus de la fauna silvestre para estimar su potencial zoonósico y pandémico.

Así, crea efectivamente una lista de vigilancia de los virus recién descubiertos para ayudar a los responsables políticos y a los científicos del ámbito de la salud a priorizarlos para una mayor caracterización, vigilancia e intervenciones de reducción de riesgos.

La herramienta está vinculada a un estudio publicado en la revista PNAS, en el que los autores identificaron los factores de riesgo virales, del huésped y del entorno más relevantes para la propagación de virus. A continuación, el equipo clasificó el riesgo de 887 virus de la fauna silvestre utilizando datos recogidos de diversas fuentes. 

LOS CORONAVIRUS DESTACAN POR SU POTENCIAL ZOONÓSICO

Los 12 primeros virus que encabezan la lista pueden afectar a los humanos, lo que era de esperar y valida la utilidad de la herramienta, según explican desde la UC Davis. Asimismo, señalan que, curiosamente, SpillOver clasificó varios coronavirus recién descubiertos como de mayor riesgo de propagación que algunos virus ya conocidos como zoonósicos. Esta lista de vigilancia incluye un nuevo coronavirus denominado provisionalmente PREDICT_CoV-35, que se clasificó entre los 20 primeros.

La ventaja de la herramienta reside en el hecho de que es de código abierto y cuantos más datos se introduzcan, más sólida será la clasificación. El SARS-CoV-2 ocupa actualmente el segundo lugar de los 887 virus analizados, entre los virus Lassa y Ébola.

Esto puede parecer contradictorio, señalan los autores, dada la actual situación mundial de la pandemia. En este sentido, explican que la herramienta está clasificando el potencial de otra propagación más allá de lo que ha ocurrido históricamente.

Además, aún no se ha descubierto información clave sobre el SARS-CoV-2 y su riesgo de propagación, como el número y el alcance de sus especies huésped. Así, han explicado que a medida que los científicos aprendan más sobre este virus, es posible que el SARS-CoV-2 pase a ser el número 1.

"El SARS-CoV-2 es sólo un ejemplo de los miles de virus que pueden propagarse de los animales a los seres humanos", ha explicado la autora principal, Zoë Grange, quien dirigió el desarrollo de SpillOver como investigadora postdoctoral en el UC Davis One Health Institute.

"Necesitamos no sólo identificar, sino también priorizar las amenazas víricas con mayor riesgo de propagación antes de que se produzca otra pandemia catastrófica. Nuestra herramienta SpillOver Viral Risk Ranking es el punto de partida para construir soluciones proactivas", apunta.

  • GALERIA

    SpillOver muestra las clasificaciones de los virus recién descubiertos con mayor riesgo de propagarse de animales a humanos

PUNTUACIÓN DE LOS VIRUS

SpillOver se inspira en las evaluaciones de riesgo que utilizan los bancos y las compañías de seguros. De esta forma, crea una puntuación "similar a la de un crédito" para los virus, examinando los factores clave de riesgo y utilizándolos para priorizar los virus que suponen las mayores amenazas potenciales para la salud humana para crear una lista de vigilancia. Los usuarios pueden adaptar la lista de vigilancia a sus propias circunstancias, como el país de interés.

Los autores indican que las herramientas anteriores de clasificación de virus se habían limitado en el número o los tipos de virus analizados, y los factores de riesgo considerados son mínimos. SpillOver tiene en cuenta 32 factores de riesgo sobre el virus y los huéspedes, incluidos el entorno y los comportamientos humanos asociados. También incluye 25 familias virales diferentes, desde los coronavirus hasta la familia viral que causa los ebolavirus.

Además, la aplicación elabora un informe de riesgo detallado para cada virus, y su herramienta 'Comparación de riesgos' permite a los usuarios comparar y contrastar los virus clasificados, así como filtrar los virus en función de una selección de atributos clave, como la especie del virus, la especie del huésped y el país de detección.

Como herramienta de código abierto, SpillOver ofrece una plataforma viva para la clasificación continua del riesgo de propagación. Los científicos pueden aportar datos sobre los virus existentes o evaluar el riesgo de nuevos virus mediante la utilidad 'Rank Your Virus'.

"SpillOver puede ayudar a avanzar en nuestra comprensión de las amenazas virales para la salud y permitirnos actuar para reducir el riesgo de contagio antes de que las pandemias puedan estallar", ha apuntado Jonna Mazet, profesora de la Facultad de Veterinaria de la UC Davis.

La aplicación involucra y permite a los científicos que están descubriendo virus colaborar en desde una perspectiva ‘One Health’ que se centra no sólo en las características virales, sino también en todas las circunstancias presentes en las zonas de alto riesgo de aparición de enfermedades. Esto, aseguran los creadores, permite que la herramienta sea un catalizador para identificar y clasificar rápidamente los virus recién descubiertos y sus interfaces de transmisión animal-humana.

Este cambio de paradigma puede facilitar la colaboración temprana, más allá de las fronteras disciplinarias y nacionales, confían los autores, que apuntan que la identificación y clasificación de los virus en función de los riesgos para la salud humana puede ayudar a los científicos a identificar los puntos críticos de control y a abordar los comportamientos humanos que ponen a las personas y a los animales en riesgo de contraer nuevas infecciones víricas.

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